Lehet cisz és transz is, de a molekulák közötti ütközések elkerülése miatt az esetek döntő többségében a transz állást veszi fel.

Transz konfiguráció okai:
-Sztérikus gátlás (térkitöltés): Cisz állásban a szénatomhoz és a nitrogénatomhoz kapcsolódó nagyobb csoportok túl közel kerülnének egymáshoz. Ez taszítást okoz, ami instabilabbá teszi a molekulát.
-Energiaállapot: A transz forma energiaszintje alacsonyabb, így a stabilabb elrendeződést részesíti előnyben.

Cisz állás előfordulása:
-A fehérjékben a prolin nevű aminosav az egyetlen, ahol a cisz forma viszonylag gyakran előfordul. Ennek oka, hogy a prolin gyűrűs szerkezete miatt a cisz és transz állapot közötti energiakülönbség sokkal kisebb, mint más aminosavaknál.
-Kisebb gyűrűs amidok: Ha a savamidcsoport egy kisméretű gyűrű része, a gyűrű záródása kényszerítheti a molekulát a cisz konformációra, mert a transz állás fizikailag nem tudna kialakulni a gyűrűn belül.