A magashegyi éghajlat jellemzően hideg és száraz, és az éghajlati viszonyok a magassággal jelentősen változnak. A Kilimandzsáró magasabb részein, például a csúcsán, ahol az átlagos magasság meghaladja a 4000 métert, a hőmérséklet általában fagypont alatt van, és a légnyomás és az oxigénszint is jelentősen csökken. Az éves csapadékmennyiség azonban eltérő lehet attól függően, hogy milyen oldalon helyezkedik el a hegység és milyen szezon van éppen.